Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc105Q9D4K7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc105Q9D4K7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc105Q9D4K7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms