Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan11Q9D1D1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms