Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krcc1Q99JT5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms