Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt16hQ920B9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt16hQ920B9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt16hQ920B9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Supt16hQ920B9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Supt16hQ920B9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt16hQ920B9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms