Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Card11Q8CIS0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Card11Q8CIS0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Card11Q8CIS0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms