Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc30Q8BVF4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms