Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snapc4Q8BP86 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms