Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Syne1Q6ZWR6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Syne1Q6ZWR6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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