Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb40Q6PCS8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms