Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtafrQ62035 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtafrQ62035 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtafrQ62035 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtafrQ62035 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtafrQ62035 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtafrQ62035 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtafrQ62035 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtafrQ62035 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtafrQ62035 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtafrQ62035 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtafrQ62035 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms