Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctf1Q60753 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms