Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Psme4Q5SSW2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms