Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WhammQ571B6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms