Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms