Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uspl1Q3ULM6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms