Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Babam1Q3UI43 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Babam1Q3UI43 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms