Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms