Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd11Q1RNF8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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