Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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ptchd1Q14B62 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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ptchd1Q14B62 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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ptchd1Q14B62 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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ptchd1Q14B62 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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ptchd1Q14B62 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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ptchd1Q14B62 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ptchd1Q14B62 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms