Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms