Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bop1P97452 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bop1P97452 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bop1P97452 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bop1P97452 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bop1P97452 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms