Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme1P97371 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Psme1P97371 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme1P97371 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Psme1P97371 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Psme1P97371 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Psme1P97371 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme1P97371 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme1P97371 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme1P97371 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Psme1P97371 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Psme1P97371 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Psme1P97371 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Psme1P97371 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Psme1P97371 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms