Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Kdm2aP59997 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm2aP59997 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms