Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defb1P56386 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb1P56386 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defb1P56386 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms