Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox2P48432 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox2P48432 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox2P48432 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox2P48432 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox2P48432 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms