Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfamP40630 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfamP40630 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfamP40630 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfamP40630 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfamP40630 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfamP40630 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfamP40630 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfamP40630 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfamP40630 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfamP40630 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfamP40630 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfamP40630 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfamP40630 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfamP40630 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfamP40630 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfamP40630 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfamP40630 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfamP40630 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfamP40630 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfamP40630 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfamP40630 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfamP40630 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TfamP40630 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TfamP40630 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TfamP40630 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TfamP40630 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.1 ms