Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga1P29974 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms