Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spi1P17433 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms