Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lamc1P02468 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lamc1P02468 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms