Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx8O88983 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx8O88983 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx8O88983 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx8O88983 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx8O88983 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx8O88983 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.8 ms