Protein–RNA interactions for Protein: O88737

Bsn, Protein bassoon, mousemouse

Predictions only

Length 3,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsnO88737 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BsnO88737 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BsnO88737 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BsnO88737 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BsnO88737 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BsnO88737 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BsnO88737 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BsnO88737 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BsnO88737 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
BsnO88737 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BsnO88737 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BsnO88737 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BsnO88737 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BsnO88737 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BsnO88737 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BsnO88737 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BsnO88737 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BsnO88737 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BsnO88737 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BsnO88737 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BsnO88737 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BsnO88737 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BsnO88737 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BsnO88737 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BsnO88737 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BsnO88737 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BsnO88737 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BsnO88737 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BsnO88737 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BsnO88737 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BsnO88737 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BsnO88737 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BsnO88737 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms