Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp2O88554 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp2O88554 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp2O88554 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp2O88554 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp2O88554 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp2O88554 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Parp2O88554 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Parp2O88554 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp2O88554 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms