Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.6 ms