Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms