Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 848.5 ms