Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm20828J3KMI7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm20828J3KMI7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm20828J3KMI7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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Gm20828J3KMI7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Gm20828J3KMI7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Gm20828J3KMI7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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