Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms