Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Trappc8E9PWG2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms