Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn7aB1AYL1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms