Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700019A02RikA0A087WPV9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms