Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm28036V9GXJ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm28036V9GXJ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm28036V9GXJ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm28036V9GXJ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm28036V9GXJ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm28036V9GXJ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm28036V9GXJ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm28036V9GXJ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm28036V9GXJ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm28036V9GXJ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm28036V9GXJ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gm28036V9GXJ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm28036V9GXJ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm28036V9GXJ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm28036V9GXJ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm28036V9GXJ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm28036V9GXJ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm28036V9GXJ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm28036V9GXJ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm28036V9GXJ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm28036V9GXJ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm28036V9GXJ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm28036V9GXJ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm28036V9GXJ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm28036V9GXJ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Gm28036V9GXJ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm28036V9GXJ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm28036V9GXJ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm28036V9GXJ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm28036V9GXJ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm28036V9GXJ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm28036V9GXJ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm28036V9GXJ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm28036V9GXJ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm28036V9GXJ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm28036V9GXJ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm28036V9GXJ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gm28036V9GXJ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gm28036V9GXJ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm28036V9GXJ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm28036V9GXJ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm28036V9GXJ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm28036V9GXJ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm28036V9GXJ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm28036V9GXJ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm28036V9GXJ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm28036V9GXJ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gm28036V9GXJ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gm28036V9GXJ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm28036V9GXJ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm28036V9GXJ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm28036V9GXJ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm28036V9GXJ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm28036V9GXJ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm28036V9GXJ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm28036V9GXJ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm28036V9GXJ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm28036V9GXJ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm28036V9GXJ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm28036V9GXJ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms