Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdfS4R2K0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PdfS4R2K0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdfS4R2K0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PdfS4R2K0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdfS4R2K0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdfS4R2K0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdfS4R2K0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PdfS4R2K0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdfS4R2K0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdfS4R2K0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdfS4R2K0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdfS4R2K0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PdfS4R2K0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms