Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd2Q9Z2E1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd2Q9Z2E1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd2Q9Z2E1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd2Q9Z2E1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd2Q9Z2E1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd2Q9Z2E1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd2Q9Z2E1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd2Q9Z2E1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mbd2Q9Z2E1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd2Q9Z2E1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd2Q9Z2E1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd2Q9Z2E1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd2Q9Z2E1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd2Q9Z2E1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd2Q9Z2E1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd2Q9Z2E1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd2Q9Z2E1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd2Q9Z2E1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd2Q9Z2E1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd2Q9Z2E1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd2Q9Z2E1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd2Q9Z2E1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd2Q9Z2E1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd2Q9Z2E1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd2Q9Z2E1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd2Q9Z2E1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd2Q9Z2E1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd2Q9Z2E1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd2Q9Z2E1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd2Q9Z2E1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd2Q9Z2E1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd2Q9Z2E1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd2Q9Z2E1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd2Q9Z2E1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd2Q9Z2E1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd2Q9Z2E1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd2Q9Z2E1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd2Q9Z2E1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd2Q9Z2E1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd2Q9Z2E1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms