Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HnrnpcQ9Z204 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HnrnpcQ9Z204 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HnrnpcQ9Z204 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HnrnpcQ9Z204 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HnrnpcQ9Z204 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HnrnpcQ9Z204 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HnrnpcQ9Z204 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HnrnpcQ9Z204 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HnrnpcQ9Z204 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HnrnpcQ9Z204 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HnrnpcQ9Z204 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HnrnpcQ9Z204 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HnrnpcQ9Z204 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HnrnpcQ9Z204 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HnrnpcQ9Z204 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HnrnpcQ9Z204 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HnrnpcQ9Z204 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HnrnpcQ9Z204 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HnrnpcQ9Z204 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HnrnpcQ9Z204 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HnrnpcQ9Z204 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HnrnpcQ9Z204 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpcQ9Z204 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpcQ9Z204 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HnrnpcQ9Z204 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HnrnpcQ9Z204 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HnrnpcQ9Z204 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HnrnpcQ9Z204 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HnrnpcQ9Z204 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HnrnpcQ9Z204 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HnrnpcQ9Z204 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HnrnpcQ9Z204 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HnrnpcQ9Z204 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HnrnpcQ9Z204 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HnrnpcQ9Z204 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HnrnpcQ9Z204 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HnrnpcQ9Z204 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HnrnpcQ9Z204 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HnrnpcQ9Z204 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HnrnpcQ9Z204 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HnrnpcQ9Z204 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms