Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Extl3Q9WVL6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Extl3Q9WVL6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Extl3Q9WVL6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Extl3Q9WVL6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Extl3Q9WVL6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Extl3Q9WVL6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Extl3Q9WVL6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Extl3Q9WVL6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Extl3Q9WVL6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Extl3Q9WVL6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Extl3Q9WVL6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Extl3Q9WVL6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Extl3Q9WVL6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Extl3Q9WVL6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Extl3Q9WVL6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Extl3Q9WVL6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Extl3Q9WVL6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Extl3Q9WVL6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Extl3Q9WVL6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Extl3Q9WVL6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Extl3Q9WVL6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Extl3Q9WVL6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Extl3Q9WVL6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Extl3Q9WVL6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Extl3Q9WVL6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Extl3Q9WVL6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Extl3Q9WVL6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Extl3Q9WVL6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Extl3Q9WVL6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Extl3Q9WVL6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Extl3Q9WVL6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Extl3Q9WVL6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Extl3Q9WVL6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Extl3Q9WVL6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Extl3Q9WVL6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Extl3Q9WVL6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Extl3Q9WVL6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Extl3Q9WVL6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Extl3Q9WVL6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Extl3Q9WVL6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Extl3Q9WVL6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Extl3Q9WVL6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Extl3Q9WVL6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Extl3Q9WVL6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Extl3Q9WVL6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Extl3Q9WVL6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Extl3Q9WVL6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Extl3Q9WVL6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Extl3Q9WVL6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Extl3Q9WVL6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Extl3Q9WVL6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Extl3Q9WVL6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Extl3Q9WVL6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Extl3Q9WVL6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Extl3Q9WVL6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Extl3Q9WVL6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Extl3Q9WVL6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Extl3Q9WVL6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Extl3Q9WVL6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Extl3Q9WVL6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Extl3Q9WVL6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Extl3Q9WVL6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Extl3Q9WVL6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Extl3Q9WVL6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Extl3Q9WVL6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Extl3Q9WVL6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Extl3Q9WVL6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Extl3Q9WVL6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms