Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arpc1bQ9WV32 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arpc1bQ9WV32 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arpc1bQ9WV32 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arpc1bQ9WV32 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arpc1bQ9WV32 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arpc1bQ9WV32 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arpc1bQ9WV32 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arpc1bQ9WV32 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arpc1bQ9WV32 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arpc1bQ9WV32 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arpc1bQ9WV32 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arpc1bQ9WV32 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arpc1bQ9WV32 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arpc1bQ9WV32 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arpc1bQ9WV32 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arpc1bQ9WV32 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arpc1bQ9WV32 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arpc1bQ9WV32 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arpc1bQ9WV32 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arpc1bQ9WV32 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arpc1bQ9WV32 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Arpc1bQ9WV32 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arpc1bQ9WV32 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Arpc1bQ9WV32 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arpc1bQ9WV32 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arpc1bQ9WV32 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arpc1bQ9WV32 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arpc1bQ9WV32 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arpc1bQ9WV32 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arpc1bQ9WV32 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arpc1bQ9WV32 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arpc1bQ9WV32 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arpc1bQ9WV32 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arpc1bQ9WV32 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms