Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mixl1Q9WUI0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mixl1Q9WUI0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mixl1Q9WUI0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mixl1Q9WUI0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mixl1Q9WUI0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mixl1Q9WUI0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mixl1Q9WUI0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mixl1Q9WUI0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mixl1Q9WUI0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mixl1Q9WUI0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mixl1Q9WUI0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mixl1Q9WUI0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mixl1Q9WUI0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mixl1Q9WUI0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mixl1Q9WUI0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mixl1Q9WUI0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mixl1Q9WUI0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mixl1Q9WUI0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mixl1Q9WUI0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mixl1Q9WUI0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mixl1Q9WUI0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mixl1Q9WUI0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mixl1Q9WUI0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mixl1Q9WUI0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mixl1Q9WUI0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mixl1Q9WUI0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mixl1Q9WUI0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mixl1Q9WUI0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mixl1Q9WUI0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mixl1Q9WUI0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mixl1Q9WUI0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mixl1Q9WUI0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mixl1Q9WUI0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mixl1Q9WUI0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mixl1Q9WUI0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mixl1Q9WUI0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mixl1Q9WUI0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mixl1Q9WUI0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms