Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUC3

Ly6h, Lymphocyte antigen 6H, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6hQ9WUC3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ly6hQ9WUC3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ly6hQ9WUC3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ly6hQ9WUC3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ly6hQ9WUC3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ly6hQ9WUC3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ly6hQ9WUC3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ly6hQ9WUC3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ly6hQ9WUC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ly6hQ9WUC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ly6hQ9WUC3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6hQ9WUC3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6hQ9WUC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ly6hQ9WUC3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6hQ9WUC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6hQ9WUC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6hQ9WUC3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6hQ9WUC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6hQ9WUC3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6hQ9WUC3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6hQ9WUC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6hQ9WUC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6hQ9WUC3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly6hQ9WUC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ly6hQ9WUC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ly6hQ9WUC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6hQ9WUC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6hQ9WUC3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6hQ9WUC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6hQ9WUC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6hQ9WUC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6hQ9WUC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6hQ9WUC3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6hQ9WUC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms