Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn5Q9WU28 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn5Q9WU28 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn5Q9WU28 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn5Q9WU28 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn5Q9WU28 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn5Q9WU28 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn5Q9WU28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn5Q9WU28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn5Q9WU28 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pfdn5Q9WU28 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfdn5Q9WU28 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn5Q9WU28 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pfdn5Q9WU28 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pfdn5Q9WU28 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pfdn5Q9WU28 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pfdn5Q9WU28 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfdn5Q9WU28 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfdn5Q9WU28 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn5Q9WU28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn5Q9WU28 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pfdn5Q9WU28 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfdn5Q9WU28 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pfdn5Q9WU28 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pfdn5Q9WU28 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms