Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn4Q9WU22 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpn4Q9WU22 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpn4Q9WU22 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpn4Q9WU22 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn4Q9WU22 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpn4Q9WU22 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn4Q9WU22 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn4Q9WU22 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn4Q9WU22 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn4Q9WU22 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn4Q9WU22 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn4Q9WU22 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn4Q9WU22 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn4Q9WU22 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn4Q9WU22 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn4Q9WU22 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpn4Q9WU22 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptpn4Q9WU22 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn4Q9WU22 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn4Q9WU22 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn4Q9WU22 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn4Q9WU22 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn4Q9WU22 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpn4Q9WU22 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn4Q9WU22 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn4Q9WU22 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn4Q9WU22 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn4Q9WU22 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn4Q9WU22 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn4Q9WU22 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn4Q9WU22 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpn4Q9WU22 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn4Q9WU22 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn4Q9WU22 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn4Q9WU22 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn4Q9WU22 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn4Q9WU22 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpn4Q9WU22 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ptpn4Q9WU22 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn4Q9WU22 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpn4Q9WU22 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpn4Q9WU22 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn4Q9WU22 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn4Q9WU22 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn4Q9WU22 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn4Q9WU22 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn4Q9WU22 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn4Q9WU22 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpn4Q9WU22 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn4Q9WU22 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpn4Q9WU22 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn4Q9WU22 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn4Q9WU22 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn4Q9WU22 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn4Q9WU22 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn4Q9WU22 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn4Q9WU22 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn4Q9WU22 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms